什么是EDF文件?
EDF(European Data Format)是一种用于存储生物医学信号的标准化文件格式,广泛应用于脑电图(EEG)、心电图(ECG)、肌电图(EMG)等生理信号的记录与交换。
注意:EDF+是EDF的扩展版本,支持更丰富的元数据和事件标记。
EDF文件结构
EDF文件由两部分组成:文件头和数据记录。
- 文件头 (256字节):包含患者信息、记录参数、信号通道数等元数据
- 数据记录:按时间顺序存储各通道的采样值
读取EDF文件的方法
使用Python (推荐)
Python的mne和pyedflib库是读取EDF文件的最佳选择。
import mne
# 读取EDF文件
raw = mne.io.read_raw_edf('example.edf', preload=True)
# 获取信号数据
data = raw.get_data()
sample_rate = raw.info['sfreq']
print(f"采样率: {sample_rate} Hz")
print(f"通道数: {len(raw.ch_names)}")
print(f"记录时长: {raw.n_times / sample_rate} 秒")
使用MATLAB
MATLAB提供了edfread函数来读取EDF文件。
% 读取EDF文件
[data, header] = edfread('example.edf');
% 显示基本信息
fprintf('采样率: %d Hz\\n', header.SampleRate);
fprintf('通道数: %d\\n', length(header.Label));
fprintf('记录时长: %d 秒\\n', size(data,1)/header.SampleRate);
常见工具与库
- pyedflib:Python的高性能EDF读写库
- MNE-Python:神经科学数据处理的完整工具包
- EDFbrowser:开源的EDF文件查看器
- BioSig:跨平台的生物信号分析工具包
应用场景
EDF文件读取技术广泛应用于:
- 临床诊断与研究
- 脑机接口(BCI)开发
- 睡眠分析
- 神经科学研究
- 医疗设备数据交换
提示:处理大型EDF文件时,建议使用流式读取或分块处理,避免内存溢出。